Đạo diễn:Đang cập nhật
Diễn viên:Đang cập nhật
Sau khi phá hủy Trái đất nhiều năm trước, tộc người ngoài hành tinh Gauna đã truy đuổi tàn dư của nhân loại - những kẻ đã trốn thoát trong gang tấc, chạy trốn khắp thiên hà trong một số con tàu hạt giống khổng lồ. Vào năm 3394, Nagate Tanikaze thoát ra khỏi cuộc sống ẩn dật suốt đời của mình sâu bên dưới con tàu hạt giống Sidonia để tìm kiếm thức ăn ở các tầng trên, nhưng lại thấy mình bị kéo vào những sự kiện đang diễn ra mà anh ta không hề hay biết.
Khi Gauna bắt đầu cuộc tấn công vào Sidonia, Tanikaze - với sự giúp đỡ của những người lính và bạn bè của anh ta là Shizuka Hoshijiro, Izana Shinatose và Yuhata Midorikawa - để bảo vệ hy vọng sống sót cuối cùng của nhân loại và đánh bại kẻ thù ngoài hành tinh của họ. Sidonia no Kishi theo chân Tanikaze khi anh khám phá ra thế giới đã ở trên anh suốt cuộc đời, và trở thành người anh hùng mà Sidonia cần.